瑞丽市人民法院设9个内设机构：综合办公室（司法警察大队）、政治部、审判管理办公室（研究室）、立案庭（诉讼服务中心）、民事审判庭、刑事审判庭、综合审判庭、涉外审判庭、执行局和1个派出法庭：畹町经济开发区法庭。

内设机构工作职责：

综合办公室（司法警察大队）：负责综合行政工作、司法装备（技术）工作、调查研究工作。做好办文办会、信息简报、代表委员联络、保密管理、档案管理、基础建设、物质装备、财务管理、后勤保障、信息化及智慧法院建设、“互联网法院”建设等工作。

司法警察大队：负责司法警务保障工作。做好机关安保维稳、应急处突、反恐反邪、特殊群体服务管理、综治维稳（平安建设）等专项工作。

政治部：负责组织人事工作、机关党务工作、党风廉政建设工作、离退休干部工作、司法改革工作、驻村工作队管理工作、人民陪审员管理工作。做好思想政治教育、学习培训、队伍建设、机关考勤、人员分类管理、法院文化、巡察督察、新闻宣传、普法宣传、法官协会、考核考评、巩固脱贫攻坚与乡村振兴衔接、文明单位创建、“工青妇”群团组织工作。

审判管理办公室（研究室）：负责审判管理（监督）工作。审理民商事案件。做好重大敏感案件指导协调（“三同步”工作）、司法建议、司法统计、审判运行态势分析通报、审判质效提升、审判体系和审判能力现代化建设等工作。

立案庭（诉讼服务中心）：负责立案（信访）工作。审理民商事案件。做好“一站式”多元解纷和诉讼服务体系建设、矛盾纠纷排查化解、诉源治理、知识产权保护、“国门法院”建设等专项工作。

刑事审判庭：负责刑事审判工作。审理刑事案件（可审涉外刑事案件）。做好常态化扫黑除恶斗争、养老诈骗等专项工作。

涉外审判庭（少年法庭）：负责涉外民商事审判工作、涉港澳台审判工作、国际司法协助工作、未成年人案件审判工作。审理涉外刑事案件、涉外民商事案件（可审民商事案件）、未成年人案件。做好打击整治跨境犯罪、强边固防、“涉外法院”建设等专项工作。

综合审判庭：负责行政审判工作。审理行政案件、民商事案件。做好促进依法行政、国家赔偿与司法救助、依法治市（法治建设）、府院联动机制建设等专项工作。

民事审判庭：负责民事审判工作。审理民商事案件。做好司法服务保障自贸试验区建设、司法助力乡村振兴战略实施、“命案防控”等专项工作。

执行局：负责执行工作。办理执行案件。做好执行指挥中心建设、巩固基本解决执行难成果、社会诚信体系建设等专项工作。

畹町经济开发区人民法庭：负责法庭工作。审理辖区民事商案件、指定类型案件。做好“红色法庭、涉侨法庭、口岸法庭、枫桥法院”建设等工作。